复制型腺相关病毒血清型2 (rcAAV2)检测试剂盒是用于定量分析检测各种使用AAV2血清型的重组腺相关病毒载体进行基因治疗、肿瘤治疗及疫苗研发等产品中可能发生的复制型腺相关病毒(Replication Competent AAV, rcAAV)的潜在风险。

本试剂盒基于荧光探针定量PCR原理，采用qPCR方法分别检测rAAV末端重复序列(ITR)（即参考基因Reference）和rcAAV的连接序列（即靶基因Target），实现对rAAV和rcAAV的同时定量检测。且配套同时含有参考基因Reference和靶基因Target的DNA定量参考品(rcAAV2 Reference&Target DNA Control)。

使用本试剂盒前需确认待测样品同时满足下述条件：

1. 待测样本中腺相关病毒的血清型为AAV2；

2. 待测样本的重组腺相关病毒载体rAAV的ITR序列需与下述rAAV2的ITR序列匹配：

>rAAV-2/N的ITR

TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT

1.抗干扰性：针对复杂基质，样本加标回收率至少能达到70-130%；

2.灵敏度高：定量下限(LLOQ)为2copies/μL，检测下限(LLOD)为0.125copies/μL；

3.精密度高：批内重复性高CV＜10%，批间差异小即中间精密度CV＜15%；

4.专属性强：特异性检测目的基因序列，不受其他外源基因组DNA干扰；

5.防干扰强：引入内部质控(IC)，可排除样本干扰、反应配制异常等，避免假阴性。

6.验证完善：参考ICH Q2（R2）分析方法验证指导原则，可提供完善的验证报告。

中美欧三国监管机构对于复制型病毒的控制阶段和检测要求基本相同，在产品生产的各个阶段以及在接受基于病毒载体的基因治疗的患者后续监测中进行检测。并且各监管机构推荐的复制型病毒的检测方法均是指示细胞培养法，该方法是复制型病毒检测的金标准。

在重组腺相关病毒(rAAV)载体生产过程中，转染用质粒DNA与rAAV会由于物理接近而导致rAAV载体基因组、Rep/Cap基因以及ITR序列发生非同源重组，这些重组序列被误包后就形成了具有复制能力的AAV，即复制型腺相关病毒(rcAAV)。

目前，rcAAV检测常采用2种方法：基于细胞培养的检测方法和qPCR快检法（直接检测法）。

FDA的指导原则建议通过全面的质量研究确认产品的关键质量属性，由于下述rcAAV的两种检测方法各有优缺点，可考虑同时采用原理互补的不同方法进行研究。

• 基于细胞培养的检测方法

通过不断的细胞传代使rcAAV实现扩增，之后再利用qPCR或Southern-blot方法进行检测，保证检测到的rcAAV都具有复制能力，是目前最常用的检测方法。

但是该方法也有它的缺陷：检测灵敏度依赖于AAV不同血清型对靶细胞的感染效率，检测值可能低于实际值；培养方法和检测平台建立也有难度，需建易感细胞株、辅助病毒库等，耗时长且投入成本较高。

• qPCR快检法（直接检测法）

对rAAV原液或终产品提取核酸后，直接利用qPCR法检测rcAAV，靶标基因一般为ITR、Rep、Cap等的连接序列，可实现对rcAAV上两种基因的检测，提高准确性。

其缺点为：检测片段短，不能保证检测目标具备rcAAV复制所需完整序列，导致检出的rcAAV不一定有复制能力，检测值相较实际值偏高。

因此，针对rcAAV的检测开发一款既能用于细胞培养后的终点检测，也能用于rcAAV直接检测的qPCR试剂盒，对于实现两种检测方法的互补验证非常有必要。

针对上述情况，翌圣生物自主研发了复制型腺相关病毒血清型2 (rcAAV2)检测试剂盒，基于荧光探针定量PCR原理，采用qPCR法分别检测rAAV末端重复序列(ITR)（即参考基因Reference）和rcAAV的连接序列（即靶基因Target），实现对rAAV和rcAAV的同时定量检测。还研发了与之配套使用的宿主细胞残留DNA样本前处理试剂盒，以及配套的自动化核酸提取仪器。用于定量分析检测各种使用AAV2血清型的重组腺相关病毒载体进行基因治疗、肿瘤治疗及疫苗研发等产品中可能发生的复制型腺相关病毒(rcAAV)的潜在风险。