Q:最佳克隆位点选择?
A:应避免选择克隆位点上下游 50 bp 内有重复序列的区域。并且克隆位点上下游 20 bp区域内 GC 含量尽量在 40%-60%范围内。
Q:载体线性化的方式有哪些?
A:酶切(包括单酶切和双酶切)或反向PCR,建议双酶切。
Q:线性化载体和目的片段扩增产物的使用量和比例?
A:载体使用量应大于 0.01 pmol,推荐使用量 0.03 pmol;克隆载体与目的片段摩尔比应在 2:1-1:5 范围内,最适为 1:2-1:3,超过范围可能会影响克隆效率。
Q:线性化载体和目的片段产物的质量会影响重组反应吗?
A:会。线性化载体或目的片段品质较差时会极大影响重组反应,会产生较高的假阳性或抑制反应。建议割胶回收纯化产物。
Q:试剂盒里面的载体可以用吗?抗性是什么?同源重组克隆试剂盒会提供终载体吗?
A:可以用,线性化载体是通过反向PCR 方式制备。氨苄抗性。不提供终载体。
Q:最小可以插入多小的片段?最大多少?
A:最小建议 100bp 以上,过短的片段可能会被核酸外切酶完全切除掉。最大 10kb, 一般片段越大,难度系数更高些。
Q:一步法快速克隆试剂盒对感受态细胞有要求吗?是否必须搭配翊圣的感受态细胞?是否可以用电转的方法?
A:不是必需搭配。推荐使用转化效率为 107 cfu/μg 以上的感受态细胞。如 Yeasen的 DH5α(cat NO. 11802ES),TOP10(cat NO. 11801ES)等。可以电转,但要用电转感受态。
Q:想同时进行多个基因表达,能否用同源重组法?
A:可以用。常用多顺反子元件载体,将多个 ORF 串联起来,同时表达多个基因。而 IRES 元件和 2A 多肽元件是最常用的。