Q：逆转录反应中的引物如何选择？
A：根据实验目的不同，可按下列建议选择（选择指南可见下表）：
a）对于全长第一链 cDNA 合成，且模板为真核生物来源，推荐选择Oligo (dT)引物。b）当目标区域具有复杂二级结构或模板为原核生物来源，推荐选择 Random Primers 引物。
c）基因特异性引物（GSP）是与模板序列互补的引物，适用于目的序列已知的情况。d）若逆转录后续为 qPCR 实验，可将 Oligo (dT)与Random Primers 混合使用。
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逆转录引物选择指南
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特征
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优点
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缺点
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结合方式
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Oligo (dT)
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1）12-20 个
T；
2）与真核生物 mRNA 的3 ’ Poly A 尾配对。
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可 合 成 全长 cDNA。
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1 ） 仅扩增有 polyA
尾 的
mRNA； 2 ） 对模板质 量 要 求高。
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Random Primers
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1）6-9 个碱基；
2）可随机识别模板并结合。
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适 合 复 杂结 构 和 微
量模板。
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特异性低， 小片段多。
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基因特异性 引 物
（GSP）
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识别特定模板序列。
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特异性强， 灵敏度高。
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仅 合 成 特定的序列。
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Q：能否用来做 miRNA/circRNA/lncRNA 的逆转录？
A：有 A 尾的 lncRNA 用预混液和 KIT （ 11123/11141/11121/11139） 都可以， circRNA、miRNA 和无 A 尾的 lncRNA 用 KIT（11121/11139）。microRNA 需要特殊的茎环引物，需特别针对的逆转录试剂盒。
Q：克隆逆转和定量逆转有什么区别？克隆逆转产物和定量逆转产物可以相互吗？
A：a）目的不同：克隆逆转后的 cDNA 后续用于基因克隆，后续实验以普通 PCR 为主； 定量逆转后的 cDNA 后续用于基因定量，后续实验以qPCR 为主。
- 逆转录过程不同：克隆逆转使用 Oligo dT，保证合成的长度。随机引物使用较少； 定量逆转使用 Oligo dT 或随机引物，或两者混合使用。
- 克隆逆转产物可用于 qPCR，但定量逆转产物不推荐用于普通 PCR，定量逆转试剂中含 Oligo (dT)与 Random Primers 混合引物，产物长度较短，可做短片段 PCR，过长的不适合。
Q：逆转录试剂盒可以逆转真菌（或其他物种）RNA 吗？有没有专门针对真菌（或其他物种）的RNA 逆转录的试剂盒呢？
A：RNA 的物种与逆转录没有很大关系，RNA 质量与逆转录有关。所以，得到 RNA 后， 逆转录试剂盒都可以用，没有特别针对的。
Q：RNase 残留降解RNA？
A：原因：若去除试剂中残留 RNase，会使 RNA 发生降解，减少了 RNA 模板量，导致效果差。
检测方法：RNA 去除试剂前后分别进行电泳检测，检测RNA 完整性。优化方法：选用无RNase 级别的 gDNA 去除试剂。
Q: miRNA茎环法逆转录可以用这款产品吗？
A: 可以的，设计特异性引物替代试剂盒中的引物加入到程序中。参考程序如下：
茎环引物（10uM) :1ul
上一步的反应液：15ul
10×super buffer：2ul
RT enzyme mix: 1ul
ddH2O: 1ul
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